我國現行事業單位會計制度自頒布實施至今，對規范事業單位會計核算，加強事業單位財務管理起到了巨大的作用。但隨著我國國內經濟不斷發展和事業單位體制改革不斷深入，現行的事業單位會計制度已遠遠滯后于我國財政管理體制改革和事業單位體制改革的步伐，適用的會計環境也發生了很大變化，使得現行的事業單位會計準則和制度呈現出不少弊端，事業單位會計制度改革勢在必行。
一、現行事業單位會計制度存在的主要問題
（一）關于會計原則
現行事業單位會計制度以收付實現制為會計核算基礎，不能充分、完整地核算和反映事業單位的所有資產、負債，對事業單位的風險管理和控制、各項業務和管理活動的績效評估造成了不利的影響，嚴重影響了事業單位的會計信息質量，從而導致會計信息缺乏真實有效性：
一是不能如實反映單位的資產和負債。事業單位會計采用收付實現制，收入、支出僅包括以現金實際收入和支付的部分，雖然能客觀地反映事業單位的現金流量，但卻不反映那些本期已經發生，但尚未用現金支付的部分，如一些事業單位拖欠的工程款；也不反映應由本期負擔，以后年度償還的債務，如借款利息，這就使得當期收入和成本費用反映不真實；單位的資產和負債反映不全面。
二是經常存在每個會計年度內收支項目不配比的情況。如固定資產的大修理費并非每年都會發生，而固定資產的使用損耗是逐年發生的。在對固定資產進行大修理的年度，根據收付實現制將修理費直接計入支出，造成當年支出增大，結余減少；同樣，有些收人是本期一次性收取，但要涉及若干期如培訓費收入，在培訓費收取的當期，收入有大幅增長，以后則可能出現負增長現象，特別是在各期培訓費收入相差較大的情況下，問題尤為突出。使得當期收支不配比，計算的結余就不具備可比性。
三是在收付實現制下，事業單位只能在實際收到付款單據時按付款金額確認和計量購入的材料物資，對未支付貨款、但已收到的物資，不登記入賬，不利于對各項物資進行全面管理；對僅支付部分款項的物資，也只能按付款單據中的實際支付金額確認和計量，顯然不能對采購業務進行確切地反映。
四是成本、費用的核算不準確。事業單位對非經營性業務采用收付實現制，不進行成本核算，難以對非經營性業務進行正確的資金使用績效評價與考核。這不僅不利于事業單位的內部管理和國家預算資金的有效使用，而且容易造成國有資產的流失。另外，雖然經營性業務要進行成本核算，但由于兩種業務通常混雜在一起，費用難以合理分攤，成本的核算極不準確，難以反映各項業務實際成本的發生情況。這既不利于加強事業單位的內部管理，也不能使預算內資金得到合理有效的使用。
（二）關于會計核算
1.固定資產核算問題
（1）固定資產折舊。事業單位會計制度沒有對固定資產是否計提折舊做出明確的規定，會計制度通用科目中沒有折舊這一科目。在實務操作中，事業單位一般不按照固定資產原值和使用年限計提折舊，為了保證固定資產的更新和維護，而是按照收入的一定比例提取修購基金作為凈資產的一部分。這種核算方式存在著以下弊端：
一是價值背離。隨著使用時間的延長，賬面價值與現時凈值會隨著時間的推移差額越來越大。
二是虛增凈資產。隨著固定資產的磨損，以賬面原值反映固定基金，使資產負債表中凈資產指標不能反映資產的實際現有生產能力狀況，虛增凈資產。
三是成本不完整。事業單位的固定資產不提折舊，業務活動成本相應也不包括折舊費用，使得成本核算不完整。一方面，事業單位在購建固定資產時，虛增了事業成本；另一方面，固定資產不計提折舊，人為降低了取得相應收入的成本，虛增了盈余，且不能真正體現會計核算的配比原則。四是按收入的比例提取修購基金，不足以維持固定資產的更新和維護，且缺乏科學合理的計提依據。
（2）購置固定資產。制度規定，單位購置固定資產應根據資金來源渠道分別列支，通過兩組分錄反映：支付款項時，借記“事業支出”、“專款支出”、“專用基金—修購基金”等科目，貸記“財政補助收入-財政直接支付”、“零余額賬戶用款額度”、“銀行存款”等科目；固定資產入賬時，借記“固定資產”科目，貸記“固定基金”科目。上述會計處理存在兩個不足：
一是以銀行存款購置固定資產，實質上并沒有引起資產減少，只是資產存在形態的一種轉換。而借記“事業支出”，勢必虛增了單位的費用支出，且期末要將該項支出轉入“事業結余”賬戶，參與事業單位的結余分配，又虛減了單位結余，有違真實性原則。
二是兩組分錄之間沒有一定的勾稽關系，不能確切明了地反映業務內涵。由于只是制度的一種硬性規定，在實際業務處理中，不少單位會計往往做了付款分錄，忘記做固定資產入賬分錄，其結果是導致賬外資產形成，容易導致國有資產流失。
2、無形資產核算問題
（1）無形資產核算方法不完備，各事業單位都缺乏嚴密的無形資產核算體系，不能客觀、真實地記錄、反映事業單位財務狀況。
按現有制度規定，對于實行內部成本核算的事業單位，其無形資產應在受益期內平均攤銷，分期計入經營支出。對于實行內部成本核算的事業單位，無形資產在受益期內平均攤銷是合理可行的，但對于不實行內部成本核算的事業單位，無形資產攤銷一次計入事業支出的會計處理尚有商榷之處。不實行內部成本核算的事業單位在核算無形資產時，只是通過借記、貸記“無形資產”科目最終轉入“事業支出”，當期“無形資產”賬戶余額為零，作為資產組成部分的無形資產也就不能在會計報表中客觀、真實地記錄、反映其存在。由于會計報表和賬戶未列示無形資產狀況，容易導致會計信息失真，就不實行內部成本核算的事業單位單位而言，不利于單位內部對這些無形資產的控制、監督管理；就國家而言，不利于國有資產的宏觀管理，容易造成國有資產的流失。例如事業單位因發展需要向國家、集體新征用土地，以支付土地出讓金、補償費等方式取得土地使用權，單位對征用的土地享有長期利用、經營的權利。事業單位在取得以上無形資產時，少則幾萬元，多則幾千萬元，不實行內部成本核算的事業單位，如果將取得的這些無形資產一次攤銷，直接計入事業支出，當月的會計報表和次年的會計賬簿中無形資產賬戶都不能反映無形資產的存在，這些無形資產就成為事業單位擁有的賬外資產。
（2）不能滿足事業單位利用無形資產對外投資的會計核算需要。
制度規定，事業單位向其他單位投入的無形資產，按雙方確定的價值，借記“對外投資”科目，按賬面原價，貸記“無形資產”科目，按其差額，借記或貸記“事業基金——投資基金”科目；同時按無形資產賬面價值，借記“事業基金——一般基金”科目，貸記“事業基金——投資基金”科目。不實行內部成本核算的事業單位，在取得無形資產時，已將取得的無形資產一次攤銷，直接計入事業支出，無形資產賬戶余額為零。那么，不實行內部成本核算的事業單位，若干年后將無形資產對外投資時，按制度規定借記“對外投資”科目，按賬面原價，貸記“無形資產”科目，就會碰到兩個問題，一是如何“按賬面原價”確定對外投資無形資產的原價？因為對外投資時無形資產賬戶余額為零；二是會出現“無形資產”科目有貸方金額沒有借方金額，期末余額為貸方的現象，這樣既使人費解，也違反了無形資產賬戶期末余額為借方的規定。
3.事業單位結余的問題。《事業單位會計準則》（試行）第三十一條規定：事業單位的凈資產是指資產減去負債的差額。包括事業基金、固定基金、專用基金、結余等。
（1）專用基金是事業單位按規定提取或者設置的具有專門用途的資金，主要有：修購基金、職工福利基金、醫療基金和住房基金。如：某事業單位有從事專門業務活動的人員100人，按照財政部門規定的公費醫療經費人均年度預算定額標準400元提取醫療基金40000元。做會計分錄借：事業支出——社會保障繳費40000；貸：專用基金——醫療基金40000.我們知道，凈資產屬于剩余權益，歸法人所有，但職工福利基金和醫療基金屬于負債性質，只能用于職工福利醫療等方面。將負債列入凈資產核算，顯然是不合適的。
（2）修購基金的問題。現行《事業事業單位會計制度》規定，提取修購基金時，借記“事業支出”，貸記“專用基金——修購基金”。這使得固定資產價值兩次被列入支出：如前所述，購置固定資產時，已經借記“事業支出”，貸記“銀行存款”等，而此處又一次借記“事業支出”，造成虛增事業支出。
（3）在事業單位會計制度中，所得稅是對事業單位收益的一種分配，按照規定，事業單位通過經營活動取得的收入，應該在年終應交所得稅，會計分錄為借：結余分配——應交所得稅；貸：應交稅金——應交所得稅。而在企業會計制度中，所得稅是企業為取得收入而發生的一項費用，會計分錄為借：所得稅；貸：應交稅金——應交所得稅。而現行的辦法，不能清晰的反映事業單位的支出情況，也不接近于國際上的處理方式。
（三）關于會計報表問題
與企業會計報表相比，事業單位會計報表兩個最大的特點是：一是從會計報表體系上看，事業單位不編制現金流量表；二是從具體會計報表的結構上看，資產負債表采用“科目余額表”的結構形式。這兩點表現出事業單位會計制度在會計報表方面的不足和缺陷。現金流量表所表現出的特殊作用是其他任何一張會計報表都不能替代的。首先，現金流量表已經成為與會計主體有利益關系的各方了解其現金變動及支付能力的重要報表，企業編制現金流量表主要是將以權責發生制為基礎的收支調整為以現金收付為基礎的收支，所以相對來說難度較大，但事業單位有很多業務就是以現金收付為基礎確定收支的，因而其編制相對比較容易；其次，事業單位尤其是實行內部成本核算和有經營性業務的事業單位，由于對這一部分業務采用了權責發生制的原則進行處理，使得其收支表中的收支不能反映現金收支的真實情況，而出資者及管理部門了解事業單位情況的一個重要方面就是可支用現金額。從這個角度看，事業單位編制現金流量表顯得非常重要。
資產負債表的結構問題。資產負債表是靜態的時點報表，反映的是某一特定日期的財務壯況的報表，它所表示的必然是一個時點而非時期。但是，事業單位規定的資產負債表項目列示不科學，格式采用的是“資產+支出=負債+凈資產+收入”的平衡原理，實際上是會計科目余額平衡表，不符合資產負債表的定義，既包括資產、負債和凈資產三類要素，也包括了“收入、支出”這類屬于特定時期的動態項目，從而使這張表失去了原來的含義。作為反映單位一定時點的財務狀況的靜態報表，列示收支類項目是不必要的，同時也與收入支出表重復。因此這種格式的資產負債表需要改進，使之符合慣例要求。
三、改進現行事業單位會計制度的對策
隨著社會主義市場經濟體制的完善和公共財政框架的構建，為了更好地規范會計核算，實施財務監督，強化資金管理，完善國庫集中收付制度，筆者針對現行事業單位會計制度存在的弊端，提出以下改進建議。
（一）實行統一的權責發生制
權責發生制是新公共管理體制下事業單位會計改革的方向。根據權責發生制原則，收入只有在提供服務時才加以確認，而且在接受服務以后，就應該將相應的義務確認為當期費用，并將其作為債務列入資產負債表，這樣，財務報表就要完整地反映單位的財政狀況和運行成果，同樣，權責發生制要求在資產負債表上確認所有的經濟資源，以便于對有關資產的管理和維護。
（二）改進相關會計要素的核算
1.固定資產折舊。筆者認為，固定資產核算方式的改進可以借鑒現行企業會計制度的規定，取消“專用基金——修購基金”科目，設置“累計折舊”科目；對固定資產計提折舊，并列入資產負債表中，作為固定資產原值的減項，充分體現固定資產凈值，以反映固定資產的新舊程度。計提折舊時，將固定資產的原值扣除其預計凈殘值的余額，在固定資產預計使用年限內，選擇合理的折舊方法進行攤銷，將每月應攤銷的折舊價值作為費用計入有關的成本或支出中，從相應的收入中得以補償。計提折舊時，借記：“事業支出——折舊費”、“經營支出——折舊費”、“成本費用——折舊費”科目，貸記“累計折舊”科目。
2.改進固定資產核算。固定資產核算可與企業會計制度同步，沒有必要保持固定資產和固定基金的對應關系，由此建議取消“固定基金”科目。購置固定資產不需按資金來源列支，可象企業會計一樣，購置入時，直接按照實際支付的全部價款，借記“固定資產”科目，貸記“財政補助收入——財政直接支付”、“零余額賬戶用款額度”、“銀行存款”有關科目。
另外，建議增加“在建工程”科目。當事業單位購置需要安裝的固定資產或者建造工程類固定資產時，先在“在建工程”中歸集相應的成本和支出，待安裝完畢或工程達到預計可使用狀態時，再從“在建工程”轉入“固定資產”賬戶。
2.改進無形資產核算
（1）健全無形資產核算體系。根據無形資產的計價方法，分門別類地對無形資產進行計價和攤銷，保證無形資產的價值在受益期內得到補償。建立和登記無形資產臺帳，建立臺帳主要有以下幾方面的作用：
一是主權主體應享有的合法權益的實在物據，一旦有侵權行為發生時，作為索賠的標準。
二是在評估時，作為評估計價的基礎。一般來講，無形資產的評估價應根據它帶來的未來收益而確定，但由于未來收益的不確定性，無形資產的成本投入，也就是某項無形資產的投入費用仍不失為評估無形資產的基本依據。
三是根據某些規定對沒有轉讓出去且已失去價值的無形資產，通知財務部門攤銷其價值。四是便于對無形資產的盤點、清查及檔案管理。
（2）為了避免在無形資產攤銷中產生賬外資產，完善無形資產的管理，建議不實行內部成本核算的事業單位，其無形資產比照固定資產進行管理和核算。購入時，直接借記“無形資產”科目，貸記“財政補助收入——財政直接支付”、“零余額賬戶用款額度”、“銀行存款”有關科目；按照無形資產的名稱設置二級明細科目進行核算，不進行攤銷。當按規定需轉為固定資產時，借記“固定資產”科目，貸記“無形資產”科目。
3.改進事業單位結余的核算。
（1）建議取消“專用基金”科目下的“福利基金”、“醫療基金”、“住房基金”等科目，將專項資金列入“其他應付款”科目核算。如上例，提取醫療基金40000元時，借：事業支出——社會保障繳費40000，貸：其他應付款40000；發生醫療費支出時（假設一次性用銀行存款支付30000元），直接做會計分錄借：其他應付款30000，貸：銀行存款30000.
（2）對修購基金的建議。如果不取消修購基金，建議將計提修購基金列入結余分配中。提取修購基金，實質是將經常性資金轉換為一般專用基金，使事業單位有一個比較穩定的固定資產更新維護的資金來源。因此通過“結余分配”賬戶提取修購基金，有利于避免現行會計核算中的弊病。
（3）將交納所得稅作為一項支出而不是對結余的分配。筆者認為，事業單位交納所得稅是一種支出而不是對收益的分配，而且這種所得稅費用觀越來越得到業內人士的認可，也更接近于國際上的處理方式。會計處理應該與企業保持一致，即：增設“所得稅”科目，年終計算應交所得稅時會計分錄：借：所得稅；貸：應交稅金——應交所得稅
（4）根據《事業單位財務規則》的規定，事業單位的結余中，僅按一定比例提取職工福利基金，剩余部分均作為事業基金，用于彌補以后年度的單位收支差額。所以，結余分配的明細賬除所得稅外只設“提取專用基金”，不再進行細分。若將修購基金作為結余分配的，其明細賬的設置需細化，即在“結余分配”總賬下的“提取專用基金”明細科目中，再設兩個三級明細科目，一是“福利基金”，二是“修購基金”。在提取修購基金時，會計分錄為：借：結余分配——提取專用基金（修購基金）；貸：專用基金——修購基金使用修購基金時，借：專用基金——修購基金；貸：銀行存款
（三）完善會計報表體系和內容。事業單位的財務會計報告可借鑒企業的財務報告體系，至少應包括會計報表和會計報表附注，強調會計報表附注的作用，對關鍵項目作出說明。對外報送的會計報表應包括資產負債表、業務活動表、預算收支總表、基本建設投資表、國有資產情況表。其中業務活動表、預算收支總表、基本建設投資表、國有資產情況表應包括上年數和本年數。這樣，事業單位會計報告形成一個完整的系統，能更好地滿足會計信息使用者的需要，也有助于事業單位會計人員建立資產負債表觀的會計理念。將現金流量表納入事業單位財務報表體系，以動態地反映其未來的現金流量，這是國際通行的慣例，也是與企業會計制度和民間非營利組織會計制度統一的需要。同時建議，將資產負債表中的收入與支出項目刪除，以“資產=負債+凈資產”為編制依據，反映單位一定時點的財務狀況的靜態報表，以全面反映事業單位的財務狀況，維護債權人利益，防止國有資產流失。